Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms