Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MRTO4Q9UKD2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MRTO4Q9UKD2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms