Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
CHORDC1Q9UHD1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHORDC1Q9UHD1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms