Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPC1L1Q9UHC9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NPC1L1Q9UHC9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NPC1L1Q9UHC9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NPC1L1Q9UHC9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NPC1L1Q9UHC9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NPC1L1Q9UHC9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NPC1L1Q9UHC9 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NPC1L1Q9UHC9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NPC1L1Q9UHC9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NPC1L1Q9UHC9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NPC1L1Q9UHC9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NPC1L1Q9UHC9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NPC1L1Q9UHC9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NPC1L1Q9UHC9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NPC1L1Q9UHC9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NPC1L1Q9UHC9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NPC1L1Q9UHC9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NPC1L1Q9UHC9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NPC1L1Q9UHC9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NPC1L1Q9UHC9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NPC1L1Q9UHC9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NPC1L1Q9UHC9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NPC1L1Q9UHC9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NPC1L1Q9UHC9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NPC1L1Q9UHC9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NPC1L1Q9UHC9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NPC1L1Q9UHC9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NPC1L1Q9UHC9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NPC1L1Q9UHC9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NPC1L1Q9UHC9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NPC1L1Q9UHC9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NPC1L1Q9UHC9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NPC1L1Q9UHC9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NPC1L1Q9UHC9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NPC1L1Q9UHC9 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NPC1L1Q9UHC9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NPC1L1Q9UHC9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NPC1L1Q9UHC9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NPC1L1Q9UHC9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NPC1L1Q9UHC9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NPC1L1Q9UHC9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NPC1L1Q9UHC9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NPC1L1Q9UHC9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NPC1L1Q9UHC9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NPC1L1Q9UHC9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NPC1L1Q9UHC9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NPC1L1Q9UHC9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NPC1L1Q9UHC9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NPC1L1Q9UHC9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NPC1L1Q9UHC9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NPC1L1Q9UHC9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NPC1L1Q9UHC9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NPC1L1Q9UHC9 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NPC1L1Q9UHC9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NPC1L1Q9UHC9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NPC1L1Q9UHC9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NPC1L1Q9UHC9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms