Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
MLH3Q9UHC1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MLH3Q9UHC1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms