Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRP68Q9UHB9 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRP68Q9UHB9 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRP68Q9UHB9 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SRP68Q9UHB9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRP68Q9UHB9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRP68Q9UHB9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRP68Q9UHB9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRP68Q9UHB9 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRP68Q9UHB9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRP68Q9UHB9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRP68Q9UHB9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRP68Q9UHB9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRP68Q9UHB9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRP68Q9UHB9 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRP68Q9UHB9 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRP68Q9UHB9 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRP68Q9UHB9 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRP68Q9UHB9 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRP68Q9UHB9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRP68Q9UHB9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRP68Q9UHB9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRP68Q9UHB9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRP68Q9UHB9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRP68Q9UHB9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRP68Q9UHB9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRP68Q9UHB9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRP68Q9UHB9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRP68Q9UHB9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SRP68Q9UHB9 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRP68Q9UHB9 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRP68Q9UHB9 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRP68Q9UHB9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRP68Q9UHB9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SRP68Q9UHB9 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SRP68Q9UHB9 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SRP68Q9UHB9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRP68Q9UHB9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRP68Q9UHB9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRP68Q9UHB9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRP68Q9UHB9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRP68Q9UHB9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRP68Q9UHB9 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRP68Q9UHB9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRP68Q9UHB9 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRP68Q9UHB9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRP68Q9UHB9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRP68Q9UHB9 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRP68Q9UHB9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRP68Q9UHB9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRP68Q9UHB9 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRP68Q9UHB9 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRP68Q9UHB9 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRP68Q9UHB9 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRP68Q9UHB9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRP68Q9UHB9 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRP68Q9UHB9 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRP68Q9UHB9 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms