Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms