Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC40.14■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC40.13■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC40.13■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.02
CCDC180Q9P1Z9 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC40.13■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC40.12■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC40.11■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC40.11■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC40.1■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC40.09■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC40.09■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC40.09■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC40.09■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC40.08■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4.01
CCDC180Q9P1Z9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
CCDC180Q9P1Z9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
CCDC180Q9P1Z9 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC40.06■■■■■ 4
CCDC180Q9P1Z9 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC40.06■■■■■ 4
CCDC180Q9P1Z9 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
CCDC180Q9P1Z9 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC40.06■■■■■ 4
CCDC180Q9P1Z9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
CCDC180Q9P1Z9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
CCDC180Q9P1Z9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
CCDC180Q9P1Z9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
CCDC180Q9P1Z9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
CCDC180Q9P1Z9 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC40.06■■■■■ 4
CCDC180Q9P1Z9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
CCDC180Q9P1Z9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
CCDC180Q9P1Z9 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
CCDC180Q9P1Z9 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
CCDC180Q9P1Z9 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms