Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GDAP2Q9NXN4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
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