Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXF8

ZDHHC7, Palmitoyltransferase ZDHHC7, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC7Q9NXF8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZDHHC7Q9NXF8 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms