Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT57Q9NWB7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms