Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW68

BSDC1, BSD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSDC1Q9NW68 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BSDC1Q9NW68 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BSDC1Q9NW68 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BSDC1Q9NW68 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BSDC1Q9NW68 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BSDC1Q9NW68 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BSDC1Q9NW68 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BSDC1Q9NW68 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BSDC1Q9NW68 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BSDC1Q9NW68 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BSDC1Q9NW68 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BSDC1Q9NW68 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BSDC1Q9NW68 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BSDC1Q9NW68 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BSDC1Q9NW68 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms