Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 SFXN5-217ENST00000485057 447 ntTSL 56.42□□□□□ -1.381e-8■■■■□ 25.3
RBM22Q9NW64 PTCD3-215ENST00000484203 928 ntTSL 26.15□□□□□ -1.422e-12■■■■□ 25.3
RBM22Q9NW64 PTCD3-213ENST00000480102 589 ntTSL 44.89□□□□□ -1.632e-12■■■■□ 25.3
RBM22Q9NW64 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.962e-12■■■■□ 25.3
RBM22Q9NW64 WDR43-201ENST00000296126 787 ntTSL 52.68□□□□□ -1.982e-12■■■■□ 25.3
RBM22Q9NW64 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.382e-7■■■■□ 25.3
RBM22Q9NW64 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.212e-7■■■■□ 25.3
RBM22Q9NW64 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.062e-7■■■■□ 25.3
RBM22Q9NW64 TNS3-206ENST00000442536 1166 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.695e-11■■■■□ 25.3
RBM22Q9NW64 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.435e-11■■■■□ 25.3
RBM22Q9NW64 CDT1-203ENST00000569140 571 ntTSL 312.96□□□□□ -0.331e-6■■■■□ 25.3
RBM22Q9NW64 ARRDC3-201ENST00000265138 4188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.343e-11■■■■□ 25.3
RBM22Q9NW64 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.161e-6■■■■□ 25.3
RBM22Q9NW64 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 16e-6■■■■□ 25.3
RBM22Q9NW64 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.656e-6■■■■□ 25.3
RBM22Q9NW64 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.656e-6■■■■□ 25.3
RBM22Q9NW64 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.376e-6■■■■□ 25.3
RBM22Q9NW64 LEPR-206ENST00000462765 2117 ntTSL 1 (best)17.16■□□□□ 0.346e-6■■■■□ 25.3
RBM22Q9NW64 RBM6-220ENST00000493652 581 ntTSL 216.28■□□□□ 0.26e-6■■■■□ 25.3
RBM22Q9NW64 DNAJB6-212ENST00000465908 694 ntTSL 316.24■□□□□ 0.196e-6■■■■□ 25.3
RBM22Q9NW64 RBM6-219ENST00000491874 480 ntTSL 315.49■□□□□ 0.076e-6■■■■□ 25.3
RBM22Q9NW64 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.076e-6■■■■□ 25.3
RBM22Q9NW64 RBM6-206ENST00000433811 582 ntTSL 314.65□□□□□ -0.066e-6■■■■□ 25.3
RBM22Q9NW64 FIP1L1-212ENST00000513975 1464 ntTSL 214.59□□□□□ -0.076e-6■■■■□ 25.3
RBM22Q9NW64 FIP1L1-205ENST00000505125 3180 ntTSL 1 (best)13.75□□□□□ -0.216e-6■■■■□ 25.3
RBM22Q9NW64 RBM6-218ENST00000488807 675 ntTSL 512.86□□□□□ -0.356e-6■■■■□ 25.3
RBM22Q9NW64 LEPR-201ENST00000344610 2935 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.376e-6■■■■□ 25.3
RBM22Q9NW64 DNAJB6-216ENST00000487480 5173 ntTSL 1 (best)10.4□□□□□ -0.746e-6■■■■□ 25.3
RBM22Q9NW64 LEPR-203ENST00000371058 2805 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.246e-6■■■■□ 25.3
RBM22Q9NW64 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.516e-6■■■■□ 25.3
RBM22Q9NW64 FIP1L1-213ENST00000514543 1465 ntTSL 54.93□□□□□ -1.626e-6■■■■□ 25.3
RBM22Q9NW64 MPP1-213ENST00000482757 989 ntTSL 28.64□□□□□ -1.031e-10■■■■□ 25.2
RBM22Q9NW64 MPP1-216ENST00000491955 2378 ntTSL 25.82□□□□□ -1.481e-10■■■■□ 25.2
RBM22Q9NW64 VWDE-203ENST00000452576 5936 ntTSL 1 (best)12.49□□□□□ -0.412e-6■■■■□ 25.2
RBM22Q9NW64 VWDE-201ENST00000275358 5260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.472e-6■■■■□ 25.2
RBM22Q9NW64 VWDE-205ENST00000521169 4700 ntTSL 511.05□□□□□ -0.642e-6■■■■□ 25.2
RBM22Q9NW64 VWDE-206ENST00000614403 4701 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.642e-6■■■■□ 25.2
RBM22Q9NW64 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.378e-8■■■■□ 25.2
RBM22Q9NW64 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.128e-8■■■■□ 25.2
RBM22Q9NW64 KMT5A-204ENST00000437519 1774 ntTSL 213.07□□□□□ -0.328e-8■■■■□ 25.2
RBM22Q9NW64 KMT5A-203ENST00000437502 901 ntTSL 511.92□□□□□ -0.58e-8■■■■□ 25.2
RBM22Q9NW64 STXBP5-202ENST00000367475 521 ntTSL 54.16□□□□□ -1.741e-8■■■■□ 25.2
RBM22Q9NW64 STXBP5-205ENST00000392291 791 ntTSL 53.64□□□□□ -1.831e-8■■■■□ 25.2
RBM22Q9NW64 PSAT1-201ENST00000347159 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.344e-8■■■■□ 25.2
RBM22Q9NW64 PSAT1-202ENST00000376588 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.574e-8■■■■□ 25.2
RBM22Q9NW64 ILF3-216ENST00000589600 839 ntTSL 524.88■■□□□ 1.576e-9■■■■□ 25.2
RBM22Q9NW64 SLC4A2-204ENST00000461735 4387 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.266e-9■■■■□ 25.2
RBM22Q9NW64 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.366e-9■■■■□ 25.2
RBM22Q9NW64 EIF1B-204ENST00000488260 637 ntTSL 25.31□□□□□ -1.568e-15■■■■□ 25.2
RBM22Q9NW64 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.578e-15■■■■□ 25.2
RBM22Q9NW64 ACLY-205ENST00000588547 471 ntTSL 39.56□□□□□ -0.882e-8■■■■□ 25.1
RBM22Q9NW64 RABL6-208ENST00000464941 3361 ntTSL 217.14■□□□□ 0.335e-8■■■■□ 25.1
RBM22Q9NW64 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 05e-8■■■■□ 25.1
RBM22Q9NW64 SETD5-201ENST00000302463 4786 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.822e-7■■■■□ 25.1
RBM22Q9NW64 SETD5-205ENST00000407969 6463 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.152e-7■■■■□ 25.1
RBM22Q9NW64 HNRNPU-228ENST00000640306 2917 ntTSL 516.68■□□□□ 0.262e-9■■■■□ 25.1
RBM22Q9NW64 EEF2-207ENST00000600794 352 ntTSL 39.18□□□□□ -0.942e-8■■■■□ 25.1
RBM22Q9NW64 SLC20A1-204ENST00000433924 638 ntTSL 412.52□□□□□ -0.412e-8■■■■□ 25.1
RBM22Q9NW64 SLC20A1-209ENST00000498224 692 ntTSL 210.74□□□□□ -0.692e-8■■■■□ 25.1
RBM22Q9NW64 SLC20A1-205ENST00000456264 574 ntTSL 45.77□□□□□ -1.492e-8■■■■□ 25.1
RBM22Q9NW64 SLC20A1-202ENST00000413135 584 ntTSL 54.15□□□□□ -1.752e-8■■■■□ 25.1
RBM22Q9NW64 SLC20A1-203ENST00000423633 668 ntTSL 23.8□□□□□ -1.82e-8■■■■□ 25.1
RBM22Q9NW64 SETD5-203ENST00000402198 6827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.72e-7■■■■□ 25.1
RBM22Q9NW64 SETD5-204ENST00000406341 6582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.062e-7■■■■□ 25.1
RBM22Q9NW64 ATF2-210ENST00000417080 2113 ntTSL 1 (best)10.85□□□□□ -0.674e-7■■■■□ 25.1
RBM22Q9NW64 ATF2-206ENST00000409635 2109 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.944e-7■■■■□ 25.1
RBM22Q9NW64 ATF2-219ENST00000456655 1861 ntTSL 1 (best)9.18□□□□□ -0.944e-7■■■■□ 25.1
RBM22Q9NW64 ATF2-209ENST00000415955 1896 ntTSL 1 (best)8.45□□□□□ -1.064e-7■■■■□ 25.1
RBM22Q9NW64 ATF2-203ENST00000392544 1919 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.164e-7■■■■□ 25.1
RBM22Q9NW64 ATF2-213ENST00000428760 1989 ntTSL 1 (best)7.73□□□□□ -1.174e-7■■■■□ 25.1
RBM22Q9NW64 ATF2-214ENST00000429579 2081 ntTSL 1 (best)7.49□□□□□ -1.214e-7■■■■□ 25.1
RBM22Q9NW64 ATF2-211ENST00000421438 1966 ntTSL 1 (best)7.24□□□□□ -1.254e-7■■■■□ 25.1
RBM22Q9NW64 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.384e-7■■■■□ 25.1
RBM22Q9NW64 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.464e-7■■■■□ 25.1
RBM22Q9NW64 ATF2-215ENST00000435004 1115 ntTSL 55.88□□□□□ -1.474e-7■■■■□ 25.1
RBM22Q9NW64 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.494e-7■■■■□ 25.1
RBM22Q9NW64 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.514e-7■■■■□ 25.1
RBM22Q9NW64 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.934e-7■■■■□ 25.1
RBM22Q9NW64 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -24e-7■■■■□ 25.1
RBM22Q9NW64 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.66e-6■■■■□ 25
RBM22Q9NW64 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.196e-6■■■■□ 25
RBM22Q9NW64 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.146e-6■■■■□ 25
RBM22Q9NW64 DNAJB6-211ENST00000459889 7992 ntTSL 1 (best)13.98□□□□□ -0.176e-6■■■■□ 25
RBM22Q9NW64 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.186e-6■■■■□ 25
RBM22Q9NW64 DNAJB6-203ENST00000417758 852 ntTSL 511.25□□□□□ -0.616e-6■■■■□ 25
RBM22Q9NW64 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.351e-7■■■■□ 25
RBM22Q9NW64 QKI-204ENST00000361758 6085 ntTSL 523.22■■□□□ 1.311e-7■■■■□ 25
RBM22Q9NW64 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.781e-7■■■■□ 25
RBM22Q9NW64 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.591e-7■■■■□ 25
RBM22Q9NW64 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.571e-7■■■■□ 25
RBM22Q9NW64 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.371e-7■■■■□ 25
RBM22Q9NW64 SF3A3-208ENST00000489537 891 ntTSL 46.46□□□□□ -1.382e-7■■■■□ 25
RBM22Q9NW64 QKI-217ENST00000545607 846 ntTSL 54.61□□□□□ -1.671e-7■■■■□ 25
RBM22Q9NW64 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.891e-7■■■■□ 25
RBM22Q9NW64 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.435e-8■■■■□ 25
RBM22Q9NW64 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.315e-8■■■■□ 25
RBM22Q9NW64 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.465e-8■■■■□ 25
RBM22Q9NW64 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.095e-8■■■■□ 25
RBM22Q9NW64 HNRNPUL1-208ENST00000595196 3043 ntTSL 1 (best)15.16■□□□□ 0.025e-8■■■■□ 25
RBM22Q9NW64 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.235e-8■■■■□ 25
Retrieved 100 of 21,863 protein–RNA pairs in 171.2 ms