Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATG3Q9NT62 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ATG3Q9NT62 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms