Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE1

MMP26, Matrix metalloproteinase-26, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP26Q9NRE1 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MMP26Q9NRE1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MMP26Q9NRE1 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
MMP26Q9NRE1 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MMP26Q9NRE1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MMP26Q9NRE1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MMP26Q9NRE1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MMP26Q9NRE1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MMP26Q9NRE1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MMP26Q9NRE1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MMP26Q9NRE1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MMP26Q9NRE1 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MMP26Q9NRE1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MMP26Q9NRE1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MMP26Q9NRE1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MMP26Q9NRE1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MMP26Q9NRE1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms