Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPAP3Q9H6T3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPAP3Q9H6T3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms