Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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