Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM6SF1Q9BZW5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM6SF1Q9BZW5 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
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