Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABARAPL3Q9BY60 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABARAPL3Q9BY60 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms