Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU40

CHRDL1, Chordin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRDL1Q9BU40 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRDL1Q9BU40 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms