Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM43Q9BTV4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM43Q9BTV4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms