Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
THUMPD2Q9BTF0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms