Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TUBA1CQ9BQE3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBA1CQ9BQE3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms