Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NLRP3Q96P20 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms