Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGD4Q96M96 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms