Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
LRRIQ1Q96JM4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
LRRIQ1Q96JM4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
LRRIQ1Q96JM4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
LRRIQ1Q96JM4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
LRRIQ1Q96JM4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
LRRIQ1Q96JM4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
LRRIQ1Q96JM4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
LRRIQ1Q96JM4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
LRRIQ1Q96JM4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
LRRIQ1Q96JM4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
LRRIQ1Q96JM4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
LRRIQ1Q96JM4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
LRRIQ1Q96JM4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
LRRIQ1Q96JM4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
LRRIQ1Q96JM4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
LRRIQ1Q96JM4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
LRRIQ1Q96JM4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
LRRIQ1Q96JM4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
LRRIQ1Q96JM4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
LRRIQ1Q96JM4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
LRRIQ1Q96JM4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
LRRIQ1Q96JM4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
LRRIQ1Q96JM4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
LRRIQ1Q96JM4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
LRRIQ1Q96JM4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
LRRIQ1Q96JM4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
LRRIQ1Q96JM4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
LRRIQ1Q96JM4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
LRRIQ1Q96JM4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
LRRIQ1Q96JM4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
LRRIQ1Q96JM4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
LRRIQ1Q96JM4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
LRRIQ1Q96JM4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
LRRIQ1Q96JM4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
LRRIQ1Q96JM4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
LRRIQ1Q96JM4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
LRRIQ1Q96JM4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
LRRIQ1Q96JM4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
LRRIQ1Q96JM4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
LRRIQ1Q96JM4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
LRRIQ1Q96JM4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
LRRIQ1Q96JM4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
LRRIQ1Q96JM4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
LRRIQ1Q96JM4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
LRRIQ1Q96JM4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
LRRIQ1Q96JM4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
LRRIQ1Q96JM4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
LRRIQ1Q96JM4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
LRRIQ1Q96JM4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
LRRIQ1Q96JM4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
LRRIQ1Q96JM4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
LRRIQ1Q96JM4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
LRRIQ1Q96JM4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
LRRIQ1Q96JM4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
LRRIQ1Q96JM4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
LRRIQ1Q96JM4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
LRRIQ1Q96JM4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
LRRIQ1Q96JM4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
LRRIQ1Q96JM4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
LRRIQ1Q96JM4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
LRRIQ1Q96JM4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
LRRIQ1Q96JM4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
LRRIQ1Q96JM4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
LRRIQ1Q96JM4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC30.31■■■□□ 2.44
LRRIQ1Q96JM4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
LRRIQ1Q96JM4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
LRRIQ1Q96JM4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
LRRIQ1Q96JM4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
LRRIQ1Q96JM4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
LRRIQ1Q96JM4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
LRRIQ1Q96JM4 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
LRRIQ1Q96JM4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
LRRIQ1Q96JM4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
LRRIQ1Q96JM4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
LRRIQ1Q96JM4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC30.3■■■□□ 2.44
LRRIQ1Q96JM4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
LRRIQ1Q96JM4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
LRRIQ1Q96JM4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
LRRIQ1Q96JM4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
LRRIQ1Q96JM4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
LRRIQ1Q96JM4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
LRRIQ1Q96JM4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
LRRIQ1Q96JM4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
LRRIQ1Q96JM4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
LRRIQ1Q96JM4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
LRRIQ1Q96JM4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
LRRIQ1Q96JM4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
LRRIQ1Q96JM4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
LRRIQ1Q96JM4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
LRRIQ1Q96JM4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
LRRIQ1Q96JM4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
LRRIQ1Q96JM4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
LRRIQ1Q96JM4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
LRRIQ1Q96JM4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
LRRIQ1Q96JM4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
LRRIQ1Q96JM4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
LRRIQ1Q96JM4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
LRRIQ1Q96JM4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
LRRIQ1Q96JM4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
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