Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
RTP4Q96DX8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RTP4Q96DX8 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RTP4Q96DX8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RTP4Q96DX8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RTP4Q96DX8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms