Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATG4CQ96DT6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG4CQ96DT6 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms