Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSR2Q969E8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSR2Q969E8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSR2Q969E8 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSR2Q969E8 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSR2Q969E8 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TSR2Q969E8 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSR2Q969E8 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSR2Q969E8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TSR2Q969E8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSR2Q969E8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSR2Q969E8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSR2Q969E8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSR2Q969E8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSR2Q969E8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSR2Q969E8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSR2Q969E8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSR2Q969E8 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSR2Q969E8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSR2Q969E8 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSR2Q969E8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSR2Q969E8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSR2Q969E8 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSR2Q969E8 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSR2Q969E8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSR2Q969E8 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSR2Q969E8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSR2Q969E8 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSR2Q969E8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSR2Q969E8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSR2Q969E8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSR2Q969E8 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSR2Q969E8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSR2Q969E8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSR2Q969E8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSR2Q969E8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TSR2Q969E8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSR2Q969E8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSR2Q969E8 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSR2Q969E8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSR2Q969E8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSR2Q969E8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSR2Q969E8 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSR2Q969E8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSR2Q969E8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSR2Q969E8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSR2Q969E8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSR2Q969E8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSR2Q969E8 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSR2Q969E8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSR2Q969E8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSR2Q969E8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSR2Q969E8 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSR2Q969E8 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSR2Q969E8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSR2Q969E8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSR2Q969E8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSR2Q969E8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms