Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BHMTQ93088 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms