Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CELF1Q92879 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CELF1Q92879 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms