Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC32.91■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
TOPBP1Q92547 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
TOPBP1Q92547 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms