Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DDX54Q8TDD1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DDX54Q8TDD1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms