Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HELBQ8NG08 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HELBQ8NG08 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HELBQ8NG08 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HELBQ8NG08 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HELBQ8NG08 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HELBQ8NG08 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HELBQ8NG08 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HELBQ8NG08 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HELBQ8NG08 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HELBQ8NG08 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HELBQ8NG08 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HELBQ8NG08 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HELBQ8NG08 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HELBQ8NG08 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HELBQ8NG08 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HELBQ8NG08 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HELBQ8NG08 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HELBQ8NG08 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HELBQ8NG08 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HELBQ8NG08 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HELBQ8NG08 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HELBQ8NG08 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HELBQ8NG08 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HELBQ8NG08 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HELBQ8NG08 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HELBQ8NG08 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HELBQ8NG08 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HELBQ8NG08 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HELBQ8NG08 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HELBQ8NG08 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HELBQ8NG08 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HELBQ8NG08 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HELBQ8NG08 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HELBQ8NG08 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HELBQ8NG08 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HELBQ8NG08 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HELBQ8NG08 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HELBQ8NG08 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HELBQ8NG08 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HELBQ8NG08 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HELBQ8NG08 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HELBQ8NG08 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HELBQ8NG08 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HELBQ8NG08 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HELBQ8NG08 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HELBQ8NG08 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HELBQ8NG08 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HELBQ8NG08 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HELBQ8NG08 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HELBQ8NG08 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HELBQ8NG08 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms