Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBW4

SLC38A9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A9Q8NBW4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC38A9Q8NBW4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms