Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AMER3Q8N944 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
AMER3Q8N944 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AMER3Q8N944 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
AMER3Q8N944 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AMER3Q8N944 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AMER3Q8N944 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
AMER3Q8N944 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
AMER3Q8N944 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
AMER3Q8N944 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
AMER3Q8N944 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
AMER3Q8N944 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AMER3Q8N944 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms