Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00518Q8N0U6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms