Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFNL1Q8IU54 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms