Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z494

NPHP3, Nephrocystin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3Q7Z494 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPHP3Q7Z494 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.84
NPHP3Q7Z494 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPHP3Q7Z494 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPHP3Q7Z494 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPHP3Q7Z494 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPHP3Q7Z494 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPHP3Q7Z494 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPHP3Q7Z494 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPHP3Q7Z494 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPHP3Q7Z494 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPHP3Q7Z494 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPHP3Q7Z494 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPHP3Q7Z494 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPHP3Q7Z494 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPHP3Q7Z494 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPHP3Q7Z494 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPHP3Q7Z494 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPHP3Q7Z494 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPHP3Q7Z494 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms