Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.32■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.32■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.31■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.3■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.3■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.29■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.29■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.29■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.28■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APTXQ7Z2E3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms