Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC2

LARP4, La-related protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 724 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP4Q71RC2 HAGH-210ENST00000567398 1473 ntTSL 216.07■□□□□ 0.162e-6■■□□□ 14.4
LARP4Q71RC2 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.042e-6■■□□□ 14.4
LARP4Q71RC2 HAGH-204ENST00000564445 864 ntTSL 313.96□□□□□ -0.172e-6■■□□□ 14.4
LARP4Q71RC2 HAGH-207ENST00000566644 612 ntTSL 511.83□□□□□ -0.522e-6■■□□□ 14.4
LARP4Q71RC2 GMPPA-209ENST00000480034 571 ntTSL 219.22■□□□□ 0.676e-7■■□□□ 14.4
LARP4Q71RC2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.516e-7■■□□□ 14.4
LARP4Q71RC2 SLC25A39-211ENST00000588767 807 ntTSL 513.74□□□□□ -0.212e-6■■□□□ 14.4
LARP4Q71RC2 GMPPA-212ENST00000496536 302 ntTSL 510.46□□□□□ -0.736e-7■■□□□ 14.4
LARP4Q71RC2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.991e-27■■□□□ 14.4
LARP4Q71RC2 HSPE1-205ENST00000465573 639 ntTSL 217.59■□□□□ 0.411e-27■■□□□ 14.4
LARP4Q71RC2 HSPE1-202ENST00000409468 570 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.281e-27■■□□□ 14.4
LARP4Q71RC2 HSPE1-204ENST00000463841 700 ntTSL 25.91□□□□□ -1.461e-27■■□□□ 14.4
LARP4Q71RC2 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.521e-27■■□□□ 14.4
LARP4Q71RC2 HLA-C-206ENST00000470363 1279 nt10.83□□□□□ -0.684e-7■■□□□ 14.4
LARP4Q71RC2 FTL-201ENST00000331825 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.543e-55■■□□□ 14.4
LARP4Q71RC2 GPX2-203ENST00000557049 476 ntTSL 34.93□□□□□ -1.623e-8■■□□□ 14.4
LARP4Q71RC2 SEZ6L2-201ENST00000308713 3801 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.923e-7■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.12e-6■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 ZYX-202ENST00000354434 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 214.89□□□□□ -0.032e-6■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 ZYX-203ENST00000392910 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.322e-6■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 AL049839.2-201ENST00000553947 3067 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.992e-12■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.255e-15■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 GLDC-216ENST00000639639 1559 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.525e-15■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 GLDC-205ENST00000638233 2046 ntTSL 1 (best)11.19□□□□□ -0.625e-15■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 GLDC-208ENST00000638661 1796 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.695e-15■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 GLDC-209ENST00000638694 1614 ntTSL 510.59□□□□□ -0.715e-15■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 GLDC-211ENST00000639318 2009 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.815e-15■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 GLDC-220ENST00000640505 1852 ntTSL 59.66□□□□□ -0.865e-15■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 GLDC-214ENST00000639461 2674 ntTSL 29.21□□□□□ -0.935e-15■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 GLDC-212ENST00000639364 3298 ntTSL 57.83□□□□□ -1.165e-15■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 GLDC-206ENST00000638274 878 ntTSL 57.19□□□□□ -1.265e-15■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 GLDC-218ENST00000639954 3279 ntTSL 57.04□□□□□ -1.285e-15■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 RTEL1-210ENST00000496816 2222 ntTSL 1 (best)19.45■□□□□ 0.73e-7■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.593e-7■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 5314 ntTSL 217.37■□□□□ 0.373e-7■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 AL645922.1-202ENST00000477310 3377 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.643e-10■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.898e-10■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.848e-10■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 ARFRP1-211ENST00000618568 1612 ntTSL 319.72■□□□□ 0.758e-10■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.688e-10■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.648e-10■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.628e-10■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.598e-10■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.48e-10■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 DBNDD2-209ENST00000443296 1233 ntTSL 217.5■□□□□ 0.398e-10■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.358e-10■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.338e-10■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.278e-10■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.248e-10■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 ARFRP1-205ENST00000610414 1251 ntTSL 216.27■□□□□ 0.28e-10■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.198e-10■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 ARFRP1-203ENST00000609188 225 ntTSL 515.74■□□□□ 0.118e-10■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 ARFRP1-209ENST00000612772 1375 ntTSL 315.67■□□□□ 0.18e-10■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.068e-10■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.095e-8■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.118e-10■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.128e-10■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 ARFRP1-206ENST00000610774 5178 ntTSL 214.19□□□□□ -0.148e-10■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.178e-10■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.279e-10■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.428e-10■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 URM1-203ENST00000372853 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.564e-6■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 PTPN23-206ENST00000602307 5119 ntTSL 211.47□□□□□ -0.579e-10■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.618e-10■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 NOP16-202ENST00000502663 551 ntTSL 311.23□□□□□ -0.618e-10■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 NOP16-210ENST00000619979 963 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.618e-10■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 NOP16-207ENST00000614830 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.698e-10■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 URM1-204ENST00000452446 2944 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.814e-6■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 NOP16-208ENST00000616685 472 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.918e-10■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 URM1-202ENST00000372850 3045 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.954e-6■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 AL390195.1-202ENST00000416099 723 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.335e-8■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 AL390195.1-201ENST00000445680 415 ntTSL 34.75□□□□□ -1.655e-8■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 P4HA2-221ENST00000506807 463 ntTSL 34.49□□□□□ -1.698e-10■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.999e-9■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 FXYD2-203ENST00000317594 1567 ntTSL 1 (best)14.49□□□□□ -0.099e-7■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 ERGIC3-206ENST00000416206 1235 ntTSL 510.75□□□□□ -0.692e-7■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.443e-11■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.413e-40■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.413e-40■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.493e-40■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 RPL37A-204ENST00000441179 529 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.23e-40■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.699e-7■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.081e-10■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 PA2G4-206ENST00000552766 1085 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.71e-10■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 EPS8L2-213ENST00000529346 1718 ntTSL 221.72■■□□□ 1.072e-6■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 EPS8L2-215ENST00000530093 414 ntTSL 421.22■□□□□ 0.992e-6■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 EPS8L2-210ENST00000527807 814 ntTSL 520.11■□□□□ 0.812e-6■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 EPS8L2-209ENST00000527199 540 ntTSL 320.11■□□□□ 0.812e-6■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 EPS8L2-224ENST00000533500 587 ntTSL 319.36■□□□□ 0.692e-6■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 EPS8L2-229ENST00000534755 474 ntTSL 418.74■□□□□ 0.592e-6■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 EPS8L2-203ENST00000524763 580 ntTSL 317.46■□□□□ 0.392e-6■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 EPS8L2-219ENST00000531348 582 ntTSL 216.26■□□□□ 0.192e-6■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.152e-6■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.142e-6■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.092e-6■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.072e-6■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 EPS8L2-206ENST00000526380 545 ntTSL 315.07■□□□□ 02e-6■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 EPS8L2-214ENST00000529680 551 ntTSL 413.87□□□□□ -0.192e-6■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 EPS8L2-208ENST00000526909 3844 ntTSL 512.57□□□□□ -0.42e-6■■□□□ 14.3
LARP4Q71RC2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.51e-6■■□□□ 14.3
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