Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIAT1Q6ZQX7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms