Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMZ3

SYNE3, Nesprin-3, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE3Q6ZMZ3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNE3Q6ZMZ3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNE3Q6ZMZ3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms