Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC174Q6PII3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC174Q6PII3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms