Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC42EP5Q6NZY7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDC42EP5Q6NZY7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms