Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
APOBEC3HQ6NTF7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC3HQ6NTF7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms