Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF3Q5VWG9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms