Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV63

ATRNL1, Attractin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1Q5VV63 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATRNL1Q5VV63 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATRNL1Q5VV63 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATRNL1Q5VV63 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATRNL1Q5VV63 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ATRNL1Q5VV63 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATRNL1Q5VV63 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATRNL1Q5VV63 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATRNL1Q5VV63 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATRNL1Q5VV63 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATRNL1Q5VV63 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATRNL1Q5VV63 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATRNL1Q5VV63 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATRNL1Q5VV63 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATRNL1Q5VV63 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATRNL1Q5VV63 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATRNL1Q5VV63 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATRNL1Q5VV63 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATRNL1Q5VV63 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATRNL1Q5VV63 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATRNL1Q5VV63 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATRNL1Q5VV63 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATRNL1Q5VV63 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ATRNL1Q5VV63 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATRNL1Q5VV63 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATRNL1Q5VV63 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ATRNL1Q5VV63 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATRNL1Q5VV63 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATRNL1Q5VV63 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATRNL1Q5VV63 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATRNL1Q5VV63 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATRNL1Q5VV63 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATRNL1Q5VV63 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATRNL1Q5VV63 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATRNL1Q5VV63 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATRNL1Q5VV63 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATRNL1Q5VV63 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATRNL1Q5VV63 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATRNL1Q5VV63 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATRNL1Q5VV63 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATRNL1Q5VV63 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATRNL1Q5VV63 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATRNL1Q5VV63 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATRNL1Q5VV63 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATRNL1Q5VV63 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ATRNL1Q5VV63 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATRNL1Q5VV63 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATRNL1Q5VV63 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATRNL1Q5VV63 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATRNL1Q5VV63 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATRNL1Q5VV63 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATRNL1Q5VV63 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATRNL1Q5VV63 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATRNL1Q5VV63 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATRNL1Q5VV63 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATRNL1Q5VV63 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATRNL1Q5VV63 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATRNL1Q5VV63 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATRNL1Q5VV63 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATRNL1Q5VV63 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATRNL1Q5VV63 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
ATRNL1Q5VV63 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATRNL1Q5VV63 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms