Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CC2D1BQ5T0F9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CC2D1BQ5T0F9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms