Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FRMPD3Q5JV73 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FRMPD3Q5JV73 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMPD3Q5JV73 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms